Na kraju sezone vrijedi još jednom čestitati Mladosti iz Ždralova na naslovu prvaka, a njihov uspjeh je veći samim time što su isto postigli i prošle sezone. Iz lige ispadaju 16-plasirani Križevci i 15-plasirani Čakovec, a umjesto njih dolaze pobjednici iz kvalifikacija.
14-plasirana Slatina ide u kvalifikacije i igrat će protiv predstavnika iz svojeg saveza, tj. županije dok ostala četiri kluba idu u izvlačenje dva para i pobjednici ulaze u 3. HNL – sjever umjesto dva posljednjeplasirana kluba. Kvalifikacije za popunu 3. HNL -Sjever održati će se 22. i 25. lipnja 2013., a kandidati za kvalifikacije su:
* Daruvar, Zdenka (Veliki Zdenci) – bjelovarsko-bilogorski savez
* Rudar (Mursko Središće) – međimurski savez
* Bratstvo (Kunovec), Borac (Imbriovec) – koprivničko-križevački savez
* Plitvica (Gojanec), Zelengaj (Kučan Donji), Rudar 47 (Ladanje) – varaždinski savez
* Papuk (Orahovica) – virovitičko-podravski savez
27. svibnja 2013. godine u Koprivnici je održan sastanak Međužupanijskog odbora “Sjever”, prisutni su: Ante Vučemilović (dopredsjednik HNS-a), Romeo Jozak (predsjednik stručne komisije HNS-a), Ivan Bedi (predsjednik komisije za mlađe uzraste), Robert Markulin (član IO HNS-a), Stjepan Križarić (član IO HNS), Josip Friščić i Danijel Lončar (ŽNS KC-KŽ), Slavko Priščan i Tomislav Barić (NSBBŽ), Mato Kljajić i Darko Jambrović (MNS), Nenad Horvatić i Ivan Novak (ŽNS Varaždin), Đuro Bukvić, Krunoslav Moslavac i Mladen Lončar (NSVPŽ), Željko Bel (ŽNS Osječko-baranjski) te Marijan Zovko (ŽNS Brodsko-posavski).
Ante Vučemilović upoznao je prisutne sa sustavom natjecanja za sezonu 2013./2014. u kojoj će 1. HNL brojiti 10 klubova, 2. HNL – 12 klubova uz mogućnost širenja na 16 klubova, 3. HNL će ostati kao i do sada (pet skupina trećih liga sa po 16 klubova), od 80 klubova koji se natječu u 3. HNL samo jedan klub dobije priliku da ide u viši rang. Prijedlog od sezone 2014./2015. je: 1. HNL – 10 klubova, 2. HNL – o broju klubova može se razgovarati, 3. HNL – tri skupine sa po 16 klubova, način popune i ostale pojedinosti vezane iz natjecanja stvar je dogovora. Romeo Jozak predstavio je prijedlog novog modela natjecanja za mlade.
Ulaskom Hrvatske 01.srpnja 2013. u EU igrači će moći sa 16 godina otići u inozemstvo (do sada 18 godina). Sljedeći primjer rada u Europi gdje u većini zemalja klubovi imaju svoje druge momčadi koje nastupaju u 3. ili 4. ligi. Prijedlog je da od sezone 2014./2015. u 3. HNL igraju juniori svih prvoligaša (koji hoće imati B-momčad), da se sadašnja 1. HNL juniora ukine, a umjesto nje uvede U-17 i U-15 kako bi se starijim pionirima omogućilo kvalitetno natjecanje jer imaju mali podražaj za napredovanje na nivou središta jer je upravo ta dob gdje mogu napredovati.
Nakon toga u konstruktivnu raspravu su se uključili svi prisutni predsjednici Županijskih saveza kao i članovi IO HNS-a. Svi su se složili da je Liga mladih dobra zamisao dok je problem sa seniorskim momčadima. Na kraju je zaključeno da će se u roku dva tjedna na nivou ŽNS-a obaviti razgovori sa svim zainteresiranim klubovima te na sljedećem sastanku ŽNS-i trebaju dostaviti svoje konačne stavove, vezano za dvije druge lige radna tijela HNS-a će raspravljati, a prijedlog za mlađe uzrasne kategorije je dobio potporu aklamacijom svih članova Međužupanijskog odbora.
ŽNS su upoznati da do 15. lipnja 2013. trebaju službeno dostaviti prijedlog delegata za 1., 2. i 3. HNL – Sjever sa svom potrebnom dokumentacijom. Dogovoreno je, da se sljedeći sastanak Međužupanijskog odbora održi za 10-15 dana na kojem će se dati konačan prijedlog o sustavu natjecanja za sezonu 2014./2015. te će se razgovarati i o drugim otvorenim pitanjima.